于PEEK合成過程中，主要采用4,4'二氟二苯甲酮和對苯二酚通過親核取代反應制備。這一過程通常要使用強堿如堿金屬氫氧化物作為催化劑，并且也許涉及高溫高壓條件下操作。于此條件下，如果設備密封不良或操作不當，則也許會釋放出微量有害氣體或蒸汽，例如氯化氫副產物。另外，于后續聚合反應中，未完全反應單體也也許殘留于產品中，這些物質若處理不當會對環境及人體健康造成危害。
為了降低毒性影響，于實際生產中必須遵守相關安全規范，包括但不限于加強車間通風換氣系統設計和維護、配備完善個人防護裝備還有定期進行職業衛生監測措施。和此同時，企業還應積極研發更加環保友好生產工藝，比如采用無毒或低毒原料替代現有體系中某些組分，從而從根本上減少甚至消除潛于風險源。
雖然聚醚醚酮生產過程中存于一定毒性問題，但只要采取科學合理管控手段，完全可以將其控制于一個可接受范圍內，確保工作人員安全和健康。
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